En 1969, Japón está ver Gate Keepers 2000 en el centro de un gran auge económico. Esto no significa que todo anime este bien. En estos tiempos de euforia unos seres misteriosos, llamados “invasores”, se están infiltrando ver Gate Keepers 2000 en Japón rápidamente y la Organización de Defensa Terrestre AEGIS es la encargada de detener a los “invasores”, para esto cuentan con un arma secreta, Ikisawa Izuniko, es una estudiante con una peculiaridad y es que puede abrir una puerta dimensional a otro mundo y puede atraer asombrosos poderes sobrenaturales. En una misión rutinaria, AEGIS detecta una gran Puerta ver Gate Keepers 2000 en la zona. Es Ukia Shun, un muchacho perdido que desconoce su tremendo poder.
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