Quinientos años ver Mushrambo 2000 en el futuro, la humanidad ha sido eliminada por los enterrícolas, criaturas genéticamente creadas a través de la unión de ADN humano y animal por el doctor Daigo Tatsuro, cuyo propósito inicial era ayudar a la raza humana a sobrevivir un poderoso virus que amenazaba con acabar toda vida sobre la faz del planeta. Una guerra se desencadenó entre ambas razas, con el vencimiento de la nueva. Aparentemente, sólo una humana sobrevivió al fin de su especie: Yakumo, la hija del doctor Tatsuro, quien sumergida ver Mushrambo 2000 en un sueño criogénico ver Mushrambo 2000 en una cápsula de tiempo, despierta ver Mushrambo 2000 en esa nueva animes época con el propósito de cumplir una misión muy especial: Llegar a Shinzo, el lugar ver Mushrambo 2000 en donde los humanos sobrevivientes huyeron, esperando su llegada. La llegada de la humana capaz de lograr la paz de ese mundo devastado y ver Mushrambo 2000 en ruinas. El camino hacia Shinzo no es fácil, pero la joven cuenta con la ayuda de tres guardianes enterrícolas: Mushra, Saago y Kutal.
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