"Seisouhen" puede traducirse más o menos como "los años que han pasado". La historia tiene su punto de partida después de varios años desde que Kenshin decidió no esgrimir más su espada y decidió no volver a luchar. Otros personajes conocidos toman parte ver Rurouni Kenshin: Seisouhen 2001 en esta parte, como Yahiko, que ha crecido hasta convertirse ver Rurouni Kenshin: Seisouhen 2001 en un adulto. Kenshin y Kaoru se han casado y tienen un hijo llamado Kenji. La conclusión de la historia de Kenshin, ver Rurouni Kenshin: Seisouhen 2001 en la cual acosado por una grave enfermedad, toma la desición de dejar su familia para ir ver Rurouni Kenshin: Seisouhen 2001 en una misión para redimirse de sus pecados como asesino.
