Lo único que Yūki recuerda de su infancia es que, perdida ver Vampire Knight en el invierno, fue atacada por un vampiro fuera de control, situación de la que la rescató otro vampiro, Kuran Kaname. Él la llevó con Kaien Cross, quien se convierte ver Vampire Knight en su padre adoptivo y más adelante, ver Vampire Knight en el director de la "Academia Privada Cross". Sin embargo, la academia de elite oculta un secreto: los alumnos de la Clase de Noche son ver Vampire Knight en realidad vampiros. El director y Kuran Kaname creen que es posible una convivencia pacífica de humanos y vampiros. Yūki y Zero, un chico procedente de una familia de cazadores de vampiros cuyos padres fueron asesinados por uno de ellos cuatro años atrás, son los únicos de la Clase de Día que conocen el secreto y se ocupan de mantener el orden ver Vampire Knight en la Academia. Zero odia a los vampiros mas que a nada ver Vampire Knight en el mundo, pero a su vez tambien oculta un gran secreto que lo tortura día a día.
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