La protagonista de la historia es Rune Ballot, una prostituta adolescente ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en la ciudad de Mardock. No pasa mucho tiempo hasta que Shell, el dueño de un casino y con otros tantos negocios turbios entre las manos, decide que sea su protegida. Rune está agradecida por lo que Shell ha hecho por ella, pero siente la imperiosa necesidad de saber por qué a ella. Investigar el pasado de Shell será su gran error, ya que la reacción del mismo será intentar matarla a toda costa, con lo que revienta un coche con ella dentro. En Mardock la tasa de criminalidad es alarmantemente exagerada, así que se pone ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en marcha una nueva animes ley conocida como “Scramble 09” que permite a la policía tomar acciones que ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en ese momento se consideran ilegales o brutales con tal de combatir todo anime crimen. Rune Ballot se ve envuelta ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en la investigación contra Shell, con lo que cogen su cuerpo chamuscado y lo montan ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en un cuerpo sintético reforzado e intentan interrogarla. Rune al despertarse tarda ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en recuperarse del estado de shock, pero cuando lo hace… su primer objetivo es vengarse de Shell. su cuerpo chamuscado y lo montan ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en un cuerpo sintático reforzado e intentan interrogarla. Rune al despertarse tarda ver Mardock Scramble: The First Compression 2010 en recuperarse del estado de shock, pero cuando lo hace su primer objetivo es vengarse de Shell.