Melvin Penal, cumpliendo su condena ver Fullmetal Alchemist: Milos No Sei-Naru Hoshi 2011 en la cárcel de la ciudad central de robo, escapa de la cárcel, y viaja hacia el oeste. Ed y Al se dedican a perseguirlo a la ciudad de Milos, donde se encuentran a una misteriosa niña Julia Criton, miembro de una organización llamada "Murciélago Negro".