“Jin Roh” se desarrolla ver Jin-Roh The Wolf Brigade 1999 en un pasado alternativo para Japón, ver Jin-Roh The Wolf Brigade 1999 en el que debido al crecimiento económico desenfrenado se generan grandes tensiones sociales, que terminan con la aparición numerosos grupos terroristas, que terminan por converger a uno llamado “Secto”. El gobierno, maniatado por una constitución que impide el uso del ejército, decide echar mano de una corporación privada para poner orden ver Jin-Roh The Wolf Brigade 1999 en las calles, constituyendo las brigadas Kerberos, fuertemente militarizadas y dedicadas a eliminar terroristas sin muchos miramientos allá donde aparezcan. Fuse es uno de estos paramilitares, que ver Jin-Roh The Wolf Brigade 1999 en una operación se encuentra con una “caperucita roja”, una niña de las que los terroristas se sirven para transportar armas y explosivos. Él es incapaz de matarla, y ella detona la carga que llevaba encima. Tras ser degradado por no haber disparado, Fuse es apartado del servicio y conoce a Handa, la hermana de la terrorista muerta, con la que comenzará a relacionarse de una manera un tanto enfermiza, preso por los remordimientos.